第一，市场制度差异。发行制度上，港股实行的是注册制，A股目前是注册制和审核制兼有；在交易制度上，港股既可以做多也可以做空，而A股没有做空机制，投资者只能通过股指期货等渠道做空。
第二，交易规则差异。比如在交易规则上，最大区别在于港股采取T 0交易机制，没有涨跌幅限制；而A股采取T 1交易，并且有涨跌限制。另外两个市场的股票面值、交易时间、清算规则等也有一定差别。
第三，投资者结构差异。A股投资者以散户为主，而港股以机构投资者为主力军。投资者结构差异也造成了两个市场投资风格的不同，散户更喜欢谋求短差价、追涨杀跌，而机构大资金追求的是长期价值升值，那些基本面差的股票很难获得投资者认可的。
2014年11月17日，上海与香港股票市场交易互联互通机制“沪港通”正式启动。
“沪港通”是“沪港股票市场交易互联互通机制”的简称，包括“沪股通”和“沪港通下的港股通”（简称“港股通”）两部分。
其中，“沪股通”是指投资者委托香港经纪商，经由联交所在上海设立的证券交易服务公司，向上交所进行申报，买卖“沪港通”规定范围内的上交所上市股票。
“沪港通下的港股通”，则是指投资者委托内地证券公司，通过上交所在香港设立的证券交易服务公司，向联交所进行申报，买卖“沪港通”规定范围内的联交所上市股票。
简而言之，我们想要买港股，不用去香港开户，我们直接在手机上开通港股通，选择S上海或深圳证券账户上开通港股通，港股通还直接以人民币与证券公司进行交收，避免了人民币出入境的不便，且投资不受每人每年等值5万美金的结汇、换汇额度限制，业务办理便捷高效。
现在开通港股通是不需要收费的。但是，投资者在开通港股通有一定的限制要求。
个人投资者需要依据具有A股证券账户，并且在申请港股通开通前20个交易日，投资者的证券账户和资产账户的资产合计不低于50万元人民币，持有的沪深两市证券市值均纳入资产计算。但是，投资者通过融资融券交易融入的资金和证券是不纳入资产计算的。而且，投资者具备港股通股票交易和外汇风险管理的基础知识，通过专项港股通知识测试在70分以上。
并且，投资者的风险测评属于C4、C5等级。如果投资者风险测评属于C3、C2、C1等级是不能开设港股通权限的。机构投资者并没有资金要求限制。
1，交易模式不同：A股为T 1交手系统，港股的为T 2交手系统，结算系统完成交割时间为每笔交易后的第2个交易日的下午3:45。
2、起始投资金额不同：A股起始投资份额最少为一百股，而港股可由发行人自行决定，所以港股参与者能够买到不够一手的碎股。
3、面值不同：港股面值没有统一规定，而A股面值则统一为一元。
4、涨跌幅限制不同：A股涨跌幅限制为上下浮动10%，港股无涨跌幅限制。
1、账户：深港通和沪港通采用“双通道”独立运行机制，深港通下的港股通和沪港通下的港股通证券账户内股票不能交叉卖出，但沪深港股通账户卖出港股的资金可以交叉使用。
2、币种：港股通交易，以港币报价成交，以人民币清算并交收。
3、订单类型：内地投资者参与港股通股票交易时，仅能使用两种订单类型：在竞价时段应当采用“竞价限价盘”委托；在持续交易时段应当采用“增强限价盘”委托。
4、委托申报：投资者参与港股通交易委托申报需输入证券代码、买卖价格、买卖数量等参数。投资者申报的价格遵循香港当地的报价规则，在港股市场，开市报价规则与持续交易时段报价规则不同，但投资者在这两个时段输入的买卖盘价格，均不可大于上日收盘价或按盘价九倍或以上及少于九分之一或以下，每个买卖盘不得超过3000手股份。
另外，港股通投资者只能在相应时间撤销订单而不可修改订单，可撤单时间为9∶00-9∶15；9∶30-12∶00；12∶30-16∶00；16∶01-16∶06。
港股执行的是T 0交易，投资者今天买入股票，就可以在今天卖出。因此如果发现了失误，就可以及时更改策略，不用等到第二天。有利于降低风险，不会延误时机。
港股的结算和交收制度采取的是T 2模式，比如今天完成股票交易，算是T0天，那么结算清算时间为之后的第二个交易日，即T 2。举个例子：周一成交股票，交收完成的时间是周三。如果是周四成交股票，那么交收时间不是周六，因为周六不是交易日，交收会在下周一完成。
